Medal Gdańsk Maraton będzie trójwymiarowy na planie kwadratu o boku 10,3 cm. Na przodzie medalu znajduje się fragment gdańskiej starówki, pomnik Neptuna i zarys trasy. U góry medalu kryształ imitujący bursztyn.

Na odwrocie medalu logo miasta Gdańska, struktura piasku symbolizująca gdańską plażę oraz miejsce na grawer imienia i czasu.