Trasa Gdańsk Maraton 2025 jest aktualnie na etapie uzgodnień z zarządcami dróg i policją. Start i meta biegu będą zlokalizowane na stadionie Polsat Plus Arena Gdańsk. Zamysłem organizatora jest, aby trasa Gdańsk Maraton przebiegała obok najbardziej charakterystycznych punktów miasta jak Europejskie Centrum Solidarności, Pomnik Poległych Stoczniowców, gdańska starówka, pomnik Neptuna, hala Ergo Arena, pas nadmorski, Park im. Rolanda Reagana czy molo Gdańsk Brzeźno.

Szczegółowa trasa zostanie opublikowana natychmiast po zakończeniu uzgodnień z zarządcami dróg.

Trasa z dniu biegu będzie posiadała atest PZLA.